Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SF3B3Q15393 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SF3B3Q15393 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SF3B3Q15393 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SF3B3Q15393 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SF3B3Q15393 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SF3B3Q15393 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
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