Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDCD1Q15116 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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