Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPRIN1Q14444 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPRIN1Q14444 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPRIN1Q14444 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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