Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKP1Q13835 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKP1Q13835 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKP1Q13835 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PKP1Q13835 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PKP1Q13835 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKP1Q13835 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
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