Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA9Q13797 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA9Q13797 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA9Q13797 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA9Q13797 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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