Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP1A4Q13733 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP1A4Q13733 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP1A4Q13733 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP1A4Q13733 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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