Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP3AQ13472 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOP3AQ13472 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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