Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF6Q13247 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF6Q13247 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF6Q13247 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF6Q13247 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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