Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM32Q13049 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM32Q13049 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM32Q13049 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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