Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIK3Q13003 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIK3Q13003 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIK3Q13003 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIK3Q13003 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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