Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP3Q12983 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNIP3Q12983 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNIP3Q12983 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3Q12983 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3Q12983 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms