Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf54Q08AI8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C2orf54Q08AI8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C2orf54Q08AI8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C2orf54Q08AI8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms