Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC4Q03721 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC4Q03721 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms