Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFF2Q03403 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFF2Q03403 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TFF2Q03403 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFF2Q03403 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFF2Q03403 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms