Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SP4Q02446 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SP4Q02446 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP4Q02446 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SP4Q02446 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SP4Q02446 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP4Q02446 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP4Q02446 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP4Q02446 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SP4Q02446 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP4Q02446 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP4Q02446 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP4Q02446 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SP4Q02446 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP4Q02446 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SP4Q02446 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SP4Q02446 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP4Q02446 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SP4Q02446 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SP4Q02446 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP4Q02446 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SP4Q02446 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SP4Q02446 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP4Q02446 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP4Q02446 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP4Q02446 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SP4Q02446 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SP4Q02446 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP4Q02446 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP4Q02446 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP4Q02446 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SP4Q02446 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SP4Q02446 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP4Q02446 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP4Q02446 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP4Q02446 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SP4Q02446 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP4Q02446 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP4Q02446 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SP4Q02446 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SP4Q02446 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SP4Q02446 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP4Q02446 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SP4Q02446 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP4Q02446 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP4Q02446 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SP4Q02446 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP4Q02446 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP4Q02446 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP4Q02446 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SP4Q02446 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP4Q02446 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP4Q02446 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP4Q02446 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP4Q02446 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SP4Q02446 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SP4Q02446 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP4Q02446 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP4Q02446 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SP4Q02446 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP4Q02446 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SP4Q02446 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP4Q02446 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SP4Q02446 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP4Q02446 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SP4Q02446 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SP4Q02446 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP4Q02446 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP4Q02446 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP4Q02446 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SP4Q02446 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP4Q02446 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP4Q02446 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SP4Q02446 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP4Q02446 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP4Q02446 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SP4Q02446 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SP4Q02446 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SP4Q02446 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SP4Q02446 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP4Q02446 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP4Q02446 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP4Q02446 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP4Q02446 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP4Q02446 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP4Q02446 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SP4Q02446 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SP4Q02446 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SP4Q02446 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SP4Q02446 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SP4Q02446 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms