Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
XPCQ01831 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
XPCQ01831 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
XPCQ01831 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
XPCQ01831 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
XPCQ01831 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
XPCQ01831 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
XPCQ01831 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
XPCQ01831 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
XPCQ01831 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
XPCQ01831 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
XPCQ01831 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
XPCQ01831 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
XPCQ01831 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
XPCQ01831 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
XPCQ01831 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
XPCQ01831 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
XPCQ01831 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
XPCQ01831 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
XPCQ01831 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
XPCQ01831 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
XPCQ01831 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
XPCQ01831 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
XPCQ01831 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
XPCQ01831 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
XPCQ01831 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
XPCQ01831 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
XPCQ01831 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
XPCQ01831 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
XPCQ01831 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
XPCQ01831 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
XPCQ01831 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
XPCQ01831 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
XPCQ01831 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
XPCQ01831 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
XPCQ01831 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
XPCQ01831 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
XPCQ01831 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
XPCQ01831 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
XPCQ01831 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
XPCQ01831 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
XPCQ01831 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
XPCQ01831 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
XPCQ01831 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
XPCQ01831 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
XPCQ01831 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
XPCQ01831 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
XPCQ01831 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
XPCQ01831 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
XPCQ01831 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
XPCQ01831 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
XPCQ01831 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
XPCQ01831 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
XPCQ01831 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
XPCQ01831 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
XPCQ01831 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
XPCQ01831 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
XPCQ01831 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
XPCQ01831 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
XPCQ01831 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
XPCQ01831 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
XPCQ01831 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
XPCQ01831 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
XPCQ01831 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
XPCQ01831 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
XPCQ01831 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
XPCQ01831 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
XPCQ01831 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
XPCQ01831 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
XPCQ01831 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
XPCQ01831 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
XPCQ01831 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
XPCQ01831 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
XPCQ01831 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
XPCQ01831 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
XPCQ01831 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
XPCQ01831 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
XPCQ01831 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
XPCQ01831 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
XPCQ01831 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
XPCQ01831 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
XPCQ01831 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
XPCQ01831 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
XPCQ01831 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
XPCQ01831 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms