Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms