Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSG4Q00888 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSG4Q00888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSG4Q00888 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms