Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
HDLBPQ00341 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HDLBPQ00341 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDLBPQ00341 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms