Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IRX6P78412 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IRX6P78412 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
IRX6P78412 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
IRX6P78412 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IRX6P78412 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IRX6P78412 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
IRX6P78412 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
IRX6P78412 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IRX6P78412 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IRX6P78412 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IRX6P78412 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IRX6P78412 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IRX6P78412 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IRX6P78412 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IRX6P78412 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IRX6P78412 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IRX6P78412 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IRX6P78412 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IRX6P78412 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IRX6P78412 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IRX6P78412 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IRX6P78412 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
IRX6P78412 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
IRX6P78412 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
IRX6P78412 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
IRX6P78412 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IRX6P78412 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IRX6P78412 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IRX6P78412 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IRX6P78412 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IRX6P78412 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IRX6P78412 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
IRX6P78412 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
IRX6P78412 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IRX6P78412 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IRX6P78412 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
IRX6P78412 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
IRX6P78412 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IRX6P78412 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IRX6P78412 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
IRX6P78412 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IRX6P78412 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IRX6P78412 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IRX6P78412 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IRX6P78412 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IRX6P78412 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IRX6P78412 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IRX6P78412 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IRX6P78412 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
IRX6P78412 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
IRX6P78412 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IRX6P78412 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IRX6P78412 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IRX6P78412 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IRX6P78412 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IRX6P78412 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
IRX6P78412 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IRX6P78412 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IRX6P78412 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IRX6P78412 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IRX6P78412 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
IRX6P78412 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IRX6P78412 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
IRX6P78412 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
IRX6P78412 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IRX6P78412 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IRX6P78412 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IRX6P78412 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IRX6P78412 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
IRX6P78412 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRX6P78412 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRX6P78412 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRX6P78412 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRX6P78412 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRX6P78412 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRX6P78412 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IRX6P78412 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IRX6P78412 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IRX6P78412 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IRX6P78412 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IRX6P78412 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IRX6P78412 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IRX6P78412 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IRX6P78412 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IRX6P78412 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IRX6P78412 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IRX6P78412 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IRX6P78412 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IRX6P78412 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IRX6P78412 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
IRX6P78412 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
IRX6P78412 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IRX6P78412 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IRX6P78412 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IRX6P78412 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
IRX6P78412 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IRX6P78412 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IRX6P78412 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IRX6P78412 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms