Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB2AP61019 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB2AP61019 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2AP61019 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms