Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARPC4P59998 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC4P59998 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARPC4P59998 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARPC4P59998 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms