Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2BFSP57053 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2BFSP57053 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
H2BFSP57053 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms