Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN17P56750 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN17P56750 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN17P56750 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms