Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPTEP56180 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPTEP56180 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPTEP56180 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPTEP56180 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPTEP56180 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPTEP56180 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPTEP56180 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPTEP56180 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTEP56180 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTEP56180 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTEP56180 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTEP56180 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTEP56180 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTEP56180 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPTEP56180 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTEP56180 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTEP56180 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTEP56180 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTEP56180 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPTEP56180 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPTEP56180 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTEP56180 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTEP56180 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTEP56180 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTEP56180 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTEP56180 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTEP56180 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPTEP56180 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTEP56180 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTEP56180 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPTEP56180 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTEP56180 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTEP56180 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTEP56180 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTEP56180 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTEP56180 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTEP56180 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPTEP56180 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPTEP56180 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPTEP56180 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPTEP56180 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPTEP56180 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPTEP56180 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms