Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FCGRTP55899 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FCGRTP55899 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FCGRTP55899 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FCGRTP55899 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms