Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFERP55789 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFERP55789 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GFERP55789 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFERP55789 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFERP55789 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GFERP55789 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GFERP55789 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFERP55789 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFERP55789 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFERP55789 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFERP55789 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFERP55789 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFERP55789 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFERP55789 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFERP55789 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFERP55789 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFERP55789 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFERP55789 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFERP55789 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFERP55789 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFERP55789 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFERP55789 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFERP55789 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFERP55789 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFERP55789 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFERP55789 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFERP55789 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GFERP55789 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFERP55789 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFERP55789 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFERP55789 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFERP55789 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFERP55789 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFERP55789 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFERP55789 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFERP55789 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFERP55789 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFERP55789 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFERP55789 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFERP55789 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFERP55789 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GFERP55789 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFERP55789 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GFERP55789 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFERP55789 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFERP55789 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFERP55789 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFERP55789 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFERP55789 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFERP55789 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFERP55789 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GFERP55789 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFERP55789 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GFERP55789 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFERP55789 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFERP55789 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFERP55789 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GFERP55789 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFERP55789 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFERP55789 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFERP55789 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFERP55789 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFERP55789 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GFERP55789 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFERP55789 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFERP55789 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GFERP55789 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GFERP55789 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFERP55789 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFERP55789 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GFERP55789 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GFERP55789 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GFERP55789 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GFERP55789 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFERP55789 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFERP55789 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.3 ms