Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH15P55291 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH15P55291 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH15P55291 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH15P55291 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH15P55291 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH15P55291 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH15P55291 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH15P55291 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH15P55291 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH15P55291 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH15P55291 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH15P55291 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH15P55291 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH15P55291 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH15P55291 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH15P55291 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH15P55291 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH15P55291 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH15P55291 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH15P55291 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH15P55291 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH15P55291 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH15P55291 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDH15P55291 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH15P55291 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH15P55291 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH15P55291 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH15P55291 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH15P55291 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH15P55291 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH15P55291 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH15P55291 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH15P55291 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH15P55291 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH15P55291 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH15P55291 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH15P55291 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH15P55291 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH15P55291 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH15P55291 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH15P55291 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH15P55291 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH15P55291 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH15P55291 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH15P55291 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH15P55291 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH15P55291 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH15P55291 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH15P55291 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH15P55291 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH15P55291 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH15P55291 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH15P55291 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH15P55291 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms