Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP5P51878 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP5P51878 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP5P51878 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP5P51878 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP5P51878 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP5P51878 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP5P51878 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CASP5P51878 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP5P51878 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP5P51878 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP5P51878 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASP5P51878 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP5P51878 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP5P51878 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP5P51878 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP5P51878 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP5P51878 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP5P51878 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP5P51878 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CASP5P51878 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP5P51878 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP5P51878 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP5P51878 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CASP5P51878 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP5P51878 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP5P51878 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP5P51878 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP5P51878 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP5P51878 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP5P51878 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP5P51878 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP5P51878 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP5P51878 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP5P51878 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP5P51878 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP5P51878 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP5P51878 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP5P51878 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP5P51878 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP5P51878 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP5P51878 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP5P51878 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP5P51878 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP5P51878 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP5P51878 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP5P51878 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP5P51878 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASP5P51878 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP5P51878 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP5P51878 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP5P51878 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP5P51878 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASP5P51878 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP5P51878 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP5P51878 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP5P51878 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP5P51878 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP5P51878 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP5P51878 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP5P51878 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASP5P51878 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP5P51878 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP5P51878 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASP5P51878 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP5P51878 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP5P51878 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP5P51878 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP5P51878 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP5P51878 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP5P51878 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP5P51878 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP5P51878 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP5P51878 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP5P51878 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP5P51878 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASP5P51878 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms