Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMDP50402 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMDP50402 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMDP50402 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMDP50402 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMDP50402 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMDP50402 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMDP50402 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMDP50402 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMDP50402 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMDP50402 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMDP50402 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMDP50402 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMDP50402 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMDP50402 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMDP50402 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMDP50402 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMDP50402 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMDP50402 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMDP50402 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EMDP50402 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMDP50402 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMDP50402 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMDP50402 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMDP50402 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMDP50402 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMDP50402 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMDP50402 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMDP50402 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMDP50402 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMDP50402 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMDP50402 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMDP50402 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMDP50402 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMDP50402 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMDP50402 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMDP50402 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMDP50402 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMDP50402 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMDP50402 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMDP50402 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMDP50402 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMDP50402 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMDP50402 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMDP50402 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMDP50402 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMDP50402 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMDP50402 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EMDP50402 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMDP50402 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EMDP50402 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMDP50402 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMDP50402 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMDP50402 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMDP50402 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMDP50402 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMDP50402 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMDP50402 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMDP50402 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMDP50402 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms