Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTCFP49711 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTCFP49711 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTCFP49711 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTCFP49711 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTCFP49711 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTCFP49711 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTCFP49711 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTCFP49711 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTCFP49711 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTCFP49711 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTCFP49711 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTCFP49711 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTCFP49711 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTCFP49711 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTCFP49711 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTCFP49711 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTCFP49711 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CTCFP49711 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTCFP49711 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTCFP49711 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTCFP49711 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTCFP49711 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTCFP49711 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTCFP49711 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTCFP49711 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTCFP49711 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTCFP49711 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTCFP49711 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTCFP49711 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTCFP49711 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTCFP49711 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTCFP49711 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTCFP49711 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CTCFP49711 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTCFP49711 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTCFP49711 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTCFP49711 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTCFP49711 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTCFP49711 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTCFP49711 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CTCFP49711 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTCFP49711 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTCFP49711 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTCFP49711 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTCFP49711 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTCFP49711 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CTCFP49711 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTCFP49711 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CTCFP49711 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTCFP49711 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTCFP49711 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTCFP49711 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTCFP49711 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTCFP49711 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTCFP49711 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTCFP49711 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTCFP49711 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTCFP49711 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTCFP49711 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTCFP49711 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTCFP49711 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTCFP49711 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTCFP49711 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTCFP49711 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTCFP49711 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTCFP49711 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTCFP49711 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTCFP49711 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTCFP49711 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTCFP49711 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTCFP49711 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTCFP49711 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTCFP49711 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTCFP49711 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTCFP49711 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CTCFP49711 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTCFP49711 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms