Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP9P49458 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP9P49458 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP9P49458 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP9P49458 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRP9P49458 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP9P49458 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP9P49458 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP9P49458 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRP9P49458 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SRP9P49458 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRP9P49458 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP9P49458 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP9P49458 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP9P49458 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRP9P49458 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRP9P49458 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP9P49458 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP9P49458 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRP9P49458 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP9P49458 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP9P49458 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP9P49458 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP9P49458 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP9P49458 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRP9P49458 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP9P49458 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP9P49458 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP9P49458 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP9P49458 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP9P49458 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP9P49458 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRP9P49458 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRP9P49458 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP9P49458 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP9P49458 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP9P49458 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP9P49458 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP9P49458 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP9P49458 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP9P49458 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP9P49458 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP9P49458 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP9P49458 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP9P49458 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP9P49458 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP9P49458 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP9P49458 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP9P49458 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP9P49458 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP9P49458 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP9P49458 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP9P49458 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP9P49458 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP9P49458 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP9P49458 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP9P49458 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP9P49458 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP9P49458 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP9P49458 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP9P49458 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP9P49458 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP9P49458 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP9P49458 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP9P49458 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP9P49458 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP9P49458 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP9P49458 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRP9P49458 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRP9P49458 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP9P49458 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP9P49458 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP9P49458 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP9P49458 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP9P49458 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP9P49458 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP9P49458 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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