Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FNTAP49354 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTAP49354 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTAP49354 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTAP49354 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTAP49354 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FNTAP49354 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FNTAP49354 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTAP49354 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTAP49354 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTAP49354 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTAP49354 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FNTAP49354 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTAP49354 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTAP49354 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FNTAP49354 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FNTAP49354 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTAP49354 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTAP49354 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTAP49354 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTAP49354 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTAP49354 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FNTAP49354 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNTAP49354 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNTAP49354 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FNTAP49354 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FNTAP49354 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTAP49354 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTAP49354 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTAP49354 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTAP49354 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTAP49354 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FNTAP49354 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNTAP49354 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNTAP49354 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNTAP49354 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNTAP49354 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FNTAP49354 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNTAP49354 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNTAP49354 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FNTAP49354 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNTAP49354 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FNTAP49354 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTAP49354 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTAP49354 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTAP49354 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTAP49354 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTAP49354 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTAP49354 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FNTAP49354 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNTAP49354 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNTAP49354 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNTAP49354 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FNTAP49354 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNTAP49354 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNTAP49354 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FNTAP49354 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNTAP49354 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNTAP49354 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FNTAP49354 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNTAP49354 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNTAP49354 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FNTAP49354 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FNTAP49354 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNTAP49354 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNTAP49354 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FNTAP49354 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNTAP49354 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNTAP49354 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNTAP49354 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNTAP49354 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNTAP49354 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNTAP49354 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNTAP49354 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNTAP49354 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNTAP49354 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNTAP49354 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNTAP49354 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTAP49354 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTAP49354 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTAP49354 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTAP49354 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTAP49354 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTAP49354 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms