Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD97P48960 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD97P48960 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD97P48960 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD97P48960 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD97P48960 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD97P48960 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD97P48960 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD97P48960 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD97P48960 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD97P48960 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD97P48960 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD97P48960 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD97P48960 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD97P48960 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD97P48960 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD97P48960 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD97P48960 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD97P48960 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD97P48960 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD97P48960 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD97P48960 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD97P48960 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD97P48960 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD97P48960 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD97P48960 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD97P48960 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD97P48960 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD97P48960 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD97P48960 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD97P48960 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD97P48960 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD97P48960 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD97P48960 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD97P48960 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD97P48960 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD97P48960 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD97P48960 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD97P48960 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD97P48960 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD97P48960 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD97P48960 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD97P48960 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD97P48960 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD97P48960 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD97P48960 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD97P48960 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD97P48960 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD97P48960 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD97P48960 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD97P48960 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD97P48960 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD97P48960 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD97P48960 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD97P48960 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD97P48960 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD97P48960 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD97P48960 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD97P48960 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD97P48960 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD97P48960 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD97P48960 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD97P48960 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD97P48960 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD97P48960 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD97P48960 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD97P48960 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD97P48960 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD97P48960 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD97P48960 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD97P48960 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD97P48960 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD97P48960 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD97P48960 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD97P48960 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD97P48960 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD97P48960 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD97P48960 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD97P48960 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD97P48960 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms