Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLMP48507 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLMP48507 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCLMP48507 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCLMP48507 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCLMP48507 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCLMP48507 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCLMP48507 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCLMP48507 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCLMP48507 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCLMP48507 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLMP48507 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLMP48507 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCLMP48507 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLMP48507 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLMP48507 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GCLMP48507 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLMP48507 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLMP48507 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLMP48507 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLMP48507 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCLMP48507 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLMP48507 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLMP48507 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLMP48507 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLMP48507 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLMP48507 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCLMP48507 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLMP48507 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLMP48507 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCLMP48507 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GCLMP48507 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GCLMP48507 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLMP48507 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLMP48507 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLMP48507 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLMP48507 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLMP48507 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCLMP48507 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCLMP48507 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCLMP48507 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCLMP48507 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLMP48507 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLMP48507 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLMP48507 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLMP48507 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLMP48507 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLMP48507 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLMP48507 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLMP48507 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLMP48507 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLMP48507 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLMP48507 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLMP48507 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLMP48507 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLMP48507 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLMP48507 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLMP48507 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLMP48507 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GCLMP48507 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLMP48507 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLMP48507 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLMP48507 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLMP48507 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLMP48507 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLMP48507 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCLMP48507 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCLMP48507 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCLMP48507 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCLMP48507 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLMP48507 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLMP48507 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLMP48507 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLMP48507 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLMP48507 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLMP48507 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLMP48507 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLMP48507 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLMP48507 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLMP48507 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLMP48507 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLMP48507 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLMP48507 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLMP48507 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms