Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A11P48066 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A11P48066 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC6A11P48066 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A11P48066 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms