Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIA4P48058 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIA4P48058 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIA4P48058 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIA4P48058 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms