Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA4P43681 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA4P43681 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA4P43681 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms