Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA4P43358 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA4P43358 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA4P43358 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGEA4P43358 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA4P43358 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGEA4P43358 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGEA4P43358 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAGEA4P43358 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA4P43358 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms