Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC1A1P43005 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC1A1P43005 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC1A1P43005 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms