Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP3P42574 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP3P42574 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP3P42574 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP3P42574 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP3P42574 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP3P42574 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP3P42574 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP3P42574 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP3P42574 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP3P42574 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP3P42574 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP3P42574 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP3P42574 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP3P42574 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP3P42574 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP3P42574 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP3P42574 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP3P42574 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP3P42574 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP3P42574 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP3P42574 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP3P42574 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP3P42574 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP3P42574 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP3P42574 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP3P42574 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP3P42574 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP3P42574 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP3P42574 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP3P42574 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP3P42574 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP3P42574 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP3P42574 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP3P42574 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP3P42574 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP3P42574 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP3P42574 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP3P42574 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP3P42574 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP3P42574 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP3P42574 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP3P42574 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP3P42574 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP3P42574 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP3P42574 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP3P42574 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP3P42574 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP3P42574 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP3P42574 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP3P42574 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP3P42574 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP3P42574 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP3P42574 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP3P42574 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP3P42574 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP3P42574 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP3P42574 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP3P42574 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP3P42574 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP3P42574 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP3P42574 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP3P42574 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP3P42574 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP3P42574 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP3P42574 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP3P42574 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP3P42574 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms