Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL4AP40617 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4AP40617 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4AP40617 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms