Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2IP36954 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2IP36954 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2IP36954 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms