Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLCN1P35523 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN1P35523 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN1P35523 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CLCN1P35523 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN1P35523 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms