Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RDXP35241 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RDXP35241 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RDXP35241 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RDXP35241 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RDXP35241 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RDXP35241 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RDXP35241 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RDXP35241 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RDXP35241 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RDXP35241 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RDXP35241 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RDXP35241 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RDXP35241 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RDXP35241 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RDXP35241 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RDXP35241 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RDXP35241 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RDXP35241 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RDXP35241 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RDXP35241 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RDXP35241 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RDXP35241 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RDXP35241 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RDXP35241 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RDXP35241 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RDXP35241 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RDXP35241 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RDXP35241 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RDXP35241 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RDXP35241 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RDXP35241 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RDXP35241 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RDXP35241 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RDXP35241 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RDXP35241 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RDXP35241 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RDXP35241 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RDXP35241 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RDXP35241 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RDXP35241 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RDXP35241 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RDXP35241 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RDXP35241 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RDXP35241 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RDXP35241 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RDXP35241 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RDXP35241 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RDXP35241 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RDXP35241 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RDXP35241 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RDXP35241 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RDXP35241 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RDXP35241 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RDXP35241 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDXP35241 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDXP35241 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDXP35241 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RDXP35241 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDXP35241 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDXP35241 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RDXP35241 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RDXP35241 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RDXP35241 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDXP35241 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDXP35241 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDXP35241 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RDXP35241 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms