Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
L1CAMP32004 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1CAMP32004 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1CAMP32004 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1CAMP32004 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
L1CAMP32004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms