Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB2P29033 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJB2P29033 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB2P29033 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJB2P29033 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB2P29033 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB2P29033 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJB2P29033 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB2P29033 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJB2P29033 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJB2P29033 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB2P29033 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJB2P29033 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJB2P29033 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB2P29033 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB2P29033 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB2P29033 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB2P29033 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB2P29033 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GJB2P29033 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB2P29033 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB2P29033 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJB2P29033 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB2P29033 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJB2P29033 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJB2P29033 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJB2P29033 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJB2P29033 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GJB2P29033 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJB2P29033 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GJB2P29033 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB2P29033 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GJB2P29033 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJB2P29033 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJB2P29033 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB2P29033 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB2P29033 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB2P29033 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB2P29033 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB2P29033 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GJB2P29033 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB2P29033 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB2P29033 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB2P29033 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB2P29033 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB2P29033 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB2P29033 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GJB2P29033 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GJB2P29033 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB2P29033 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB2P29033 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GJB2P29033 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB2P29033 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB2P29033 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJB2P29033 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GJB2P29033 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB2P29033 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB2P29033 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB2P29033 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB2P29033 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB2P29033 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB2P29033 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB2P29033 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB2P29033 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB2P29033 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB2P29033 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB2P29033 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB2P29033 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB2P29033 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB2P29033 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB2P29033 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB2P29033 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB2P29033 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB2P29033 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB2P29033 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB2P29033 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB2P29033 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB2P29033 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB2P29033 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB2P29033 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB2P29033 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB2P29033 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB2P29033 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB2P29033 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB2P29033 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB2P29033 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB2P29033 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB2P29033 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB2P29033 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms