Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFRSF8P28908 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF8P28908 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF8P28908 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF8P28908 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms