Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CANXP27824 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CANXP27824 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CANXP27824 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CANXP27824 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CANXP27824 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CANXP27824 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CANXP27824 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CANXP27824 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CANXP27824 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CANXP27824 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CANXP27824 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CANXP27824 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CANXP27824 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CANXP27824 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CANXP27824 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CANXP27824 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CANXP27824 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CANXP27824 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CANXP27824 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CANXP27824 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CANXP27824 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CANXP27824 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CANXP27824 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CANXP27824 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CANXP27824 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CANXP27824 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CANXP27824 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CANXP27824 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CANXP27824 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CANXP27824 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CANXP27824 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CANXP27824 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CANXP27824 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CANXP27824 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CANXP27824 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CANXP27824 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CANXP27824 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CANXP27824 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CANXP27824 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CANXP27824 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CANXP27824 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CANXP27824 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CANXP27824 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CANXP27824 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CANXP27824 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CANXP27824 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CANXP27824 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CANXP27824 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CANXP27824 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CANXP27824 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CANXP27824 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CANXP27824 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CANXP27824 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CANXP27824 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CANXP27824 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CANXP27824 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CANXP27824 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CANXP27824 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CANXP27824 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CANXP27824 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CANXP27824 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CANXP27824 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CANXP27824 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CANXP27824 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CANXP27824 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CANXP27824 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CANXP27824 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CANXP27824 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CANXP27824 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CANXP27824 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CANXP27824 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CANXP27824 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CANXP27824 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CANXP27824 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CANXP27824 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CANXP27824 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CANXP27824 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CANXP27824 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CANXP27824 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CANXP27824 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CANXP27824 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CANXP27824 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CANXP27824 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CANXP27824 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CANXP27824 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CANXP27824 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CANXP27824 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CANXP27824 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CANXP27824 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CANXP27824 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CANXP27824 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CANXP27824 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CANXP27824 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CANXP27824 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CANXP27824 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CANXP27824 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CANXP27824 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CANXP27824 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CANXP27824 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms