Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PTPRGP23470 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PTPRGP23470 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PTPRGP23470 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRGP23470 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRGP23470 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRGP23470 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRGP23470 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRGP23470 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRGP23470 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRGP23470 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
PTPRGP23470 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PTPRGP23470 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRGP23470 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRGP23470 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRGP23470 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC40.04■■■■■ 4
PTPRGP23470 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PTPRGP23470 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PTPRGP23470 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PTPRGP23470 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PTPRGP23470 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PTPRGP23470 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRGP23470 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRGP23470 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRGP23470 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
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