Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHBP21912 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHBP21912 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHBP21912 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHBP21912 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHBP21912 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHBP21912 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHBP21912 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHBP21912 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHBP21912 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHBP21912 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SDHBP21912 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDHBP21912 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDHBP21912 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDHBP21912 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDHBP21912 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHBP21912 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHBP21912 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHBP21912 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHBP21912 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHBP21912 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHBP21912 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDHBP21912 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDHBP21912 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDHBP21912 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDHBP21912 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDHBP21912 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDHBP21912 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHBP21912 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHBP21912 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHBP21912 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHBP21912 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHBP21912 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHBP21912 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHBP21912 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHBP21912 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHBP21912 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHBP21912 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHBP21912 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHBP21912 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHBP21912 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHBP21912 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHBP21912 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHBP21912 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHBP21912 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHBP21912 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHBP21912 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHBP21912 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHBP21912 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDHBP21912 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDHBP21912 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDHBP21912 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SDHBP21912 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHBP21912 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHBP21912 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHBP21912 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHBP21912 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHBP21912 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHBP21912 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHBP21912 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHBP21912 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHBP21912 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHBP21912 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHBP21912 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHBP21912 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDHBP21912 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDHBP21912 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SDHBP21912 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHBP21912 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHBP21912 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHBP21912 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHBP21912 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHBP21912 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDHBP21912 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDHBP21912 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDHBP21912 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDHBP21912 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDHBP21912 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDHBP21912 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDHBP21912 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDHBP21912 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDHBP21912 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHBP21912 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHBP21912 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHBP21912 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHBP21912 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHBP21912 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHBP21912 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHBP21912 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms